Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms