Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms