Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VAMP4O75379 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms