Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB3O43889 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB3O43889 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB3O43889 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB3O43889 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CREB3O43889 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB3O43889 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms