Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms