Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DENRO43583 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DENRO43583 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DENRO43583 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DENRO43583 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms