Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms