Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms