Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNMO15061 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNMO15061 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNMO15061 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNMO15061 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNMO15061 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNMO15061 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNMO15061 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNMO15061 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNMO15061 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms