Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APAF1O14727 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APAF1O14727 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APAF1O14727 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APAF1O14727 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APAF1O14727 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APAF1O14727 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APAF1O14727 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms