Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms