Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIP1O00291 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIP1O00291 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIP1O00291 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIP1O00291 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIP1O00291 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIP1O00291 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms