Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms