Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms