Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD3A6NKT7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms