Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM200CA6NKL6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms