Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms