Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms