Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms