Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms