Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms