Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG4BQ9Y4P1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms