Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms