Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms