Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms