Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms