Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms