Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms