Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF639Q9UID6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms