Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms