Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms