Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD4AQ9P2Q2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD4AQ9P2Q2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms