Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms