Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD3Q9P035 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD3Q9P035 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms