Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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