Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS1Q9NYS0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms