Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms