Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms