Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms