Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS45Q9NRW7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms