Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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LHX9Q9NQ69 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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LHX9Q9NQ69 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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