Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB6Q9NP58 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms