Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms