Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms