Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX4Q9H1E5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX4Q9H1E5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms