Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms