Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms