Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms