Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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