Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms